Die enge Zusammenarbeit zwischen dem Binnenschifffahrtsgewerbe und der ZKR ist eines der wesentlichen Merkmale und ein wichtiger Erfolgsfaktor der Zentralkommission.
In letzter Zeit war sie bemüht, den seit jeher sehr intensiven Beziehungen durch die Einführung des Status einer anerkannten Nichtregierungsorganisation und der Einrichtung der Beratenden Konferenz einen förmlicheren Rahmen zu geben.